11月5日，考古队经浅地层剖面直线切割，证明在原来2号堆又有3处文物堆积点，有一部分被“压”在新建的西堤下。探测的另一个重大发现是，郑成功战船在此沉没不是1艘而是2艘；而且在约1000多平方米沉址之下，还沉有1艘宋元时期运载瓷器的商船，两船呈相叠交错状。小小的冬古港缘何有古沉船？古商船欲往何处？对此，考古专家认为须待明年正式发掘论证。但对今日冬古港在宋元时期只是一个小港湾，数海里外即是南来北往的水上“丝绸之路”，故船只一旦与飓风相遇，则十有八九会被卷入在此沉没的结论是一致的。